¿Cuánto cobra cada plataforma por transacción?
Aquí es donde la mayoría de las comparativas fallan: presentan el porcentaje sin contar el costo fijo ni el IVA. Los tres juntos determinan lo que realmente pagas.
Conekta
- Tarjeta: 2.9% + $2.50 MXN + IVA (16%)
- OXXO (efectivo): 3.9% + IVA
- Transferencia SPEI: $12.50 MXN fijo
El IVA aplica sobre la comisión completa, no sobre la venta. Eso significa que en una venta de $1,000 MXN, el 2.9% + $2.50 MXN ya suma $31.50 antes de IVA. Con IVA, el cargo real es $36.54.
Stripe
- Tarjeta (crédito/débito): 3.6% + $3 MXN
- El IVA no aparece desglosado en la tarifa pública de Stripe México; verifica con tu contador cómo impacta en tu operación fiscal.
En una venta de $1,000 MXN: $39 de comisión efectiva. Stripe es más cara en tickets bajos y medianos por el porcentaje más alto, pero no tiene cargo adicional por OXXO ni efectivo porque simplemente no los acepta.
Mercado Pago
- Checkout: 3.49% + $4 MXN + IVA (16%)
- Link de pago (30 días de espera): 2.95% + $4 MXN + IVA
- Link de pago (3 días de espera): 3.79% + $4 MXN + IVA
La lógica de Mercado Pago es inversa: pagas más para recibir tu dinero más rápido. Si puedes esperar 30 días, obtienes la tasa más baja. Si necesitas el dinero en 3 días, la tasa sube. Es un modelo que funciona si tienes liquidez para esperar, pero que castiga a negocios con flujo ajustado.
Tabla comparativa de comisiones (tarjeta, $1,000 MXN)
| Plataforma | Tasa | Costo fijo | IVA sobre comisión | Costo real aprox. |
|---|---|---|---|---|
| Conekta | 2.9% | $2.50 MXN | Sí (16%) | ~$36.54 MXN |
| Stripe | 3.6% | $3 MXN | No desglosado | ~$39 MXN |
| Mercado Pago (checkout) | 3.49% | $4 MXN | Sí (16%) | ~$44.89 MXN |
Para tickets alrededor de $1,500 MXN, Conekta resulta más económica. En tickets de $5,000 MXN o más, Stripe puede ser la opción con menor costo efectivo dependiendo del desglose de IVA. Mercado Pago solo conviene en precio si tu cliente no tiene tarjeta y necesita pagar en OXXO o con QR.
Si quieres profundizar en qué pasarelas ofrecen las comisiones más competitivas del mercado actual, te recomendamos consultar nuestro análisis sobre plataformas de pago con menos comisiones para ecommerce en México, donde encontrarás alternativas emergentes y actualizaciones periódicas de tasas.
¿Qué métodos de pago acepta cada uno?
Este criterio muchas veces pesa más que las comisiones. En México, el 59.5% de los compradores en línea compra semanalmente según datos de Digital 2026 MX, pero no todos tienen tarjeta de crédito activa o confían en usarla en línea. Si quieres ampliar tus opciones de pago, vender en línea con OXXO, efectivo y SPEI es una estrategia que atrae más clientes potenciales.
| Método | Conekta | Stripe | Mercado Pago |
|---|---|---|---|
| Tarjeta crédito/débito | ✅ | ✅ | ✅ |
| OXXO / efectivo | ✅ | ❌ | ✅ |
| Transferencia SPEI | ✅ | ✅ | ✅ |
| Apple Pay / Google Pay | ❌ | ✅ | ❌ |
| QR presencial | ❌ | ❌ | ✅ |
| Meses sin intereses | ✅ | ❌ | ✅ |
| Billetera digital propia | ❌ | ❌ | ✅ |
| ✅ | ✅ | ✅ |
Stripe es la mejor opción técnica si tu cliente típico paga con tarjeta internacional o billeteras digitales (Apple Pay, Google Pay). Fuerte para negocios con clientes del extranjero o perfiles tech-savvy.
Conekta cubre el mercado mexicano bien: tarjetas nacionales, OXXO, SPEI y meses sin intereses. Es empresa 100% mexicana regulada por la CNBV, lo que facilita el soporte en español y la integración con bancos locales. Si necesitas comparar Conekta con otras opciones orientadas a PyMEs, consulta nuestro análisis de Clip vs iZettle vs Conekta: diferencias para PyMEs en México, que incluye pasarelas especializadas en ese segmento.
Mercado Pago tiene la red más completa: agrega QR para cobros presenciales, la billetera de Mercado Libre (que usa millones de compradores habituales) y cobertura en tiendas de conveniencia. Si tienes tanto canal digital como físico, o si tu audiencia ya compra en Mercado Libre, esta red pesa mucho. Si vendes activamente en esa plataforma, descubre cómo vender en Mercado Libre y recibir pagos seguros en 2026 para entender las mejores prácticas de cobro y seguridad en ese ecosistema.
Todas estas plataformas también permiten cobrar a través de cómo cobrar por WhatsApp a tus clientes en México, una tendencia creciente para negocios que atienden directamente en ese canal y buscan simplificar el flujo de cobro sin redirigir a terceros.
¿Cuánto tiempo tardan en depositar tu dinero?
Un factor que los comparativos suelen minimizar —hasta que tienes que pagar a proveedores.
- Conekta: 2 días hábiles. El más predecible para planear flujo de caja.
- Stripe: 7 días. El más lento de los tres, aunque consistente.
- Mercado Pago: Variable. Puede ser inmediato (tasa más cara), 14 días o 30 días (tasa más baja). Tienes control, pero hay un costo real por cada opción.
Si manejas un negocio con márgenes ajustados o ciclos de recompra cortos, esperar 7 días con Stripe puede ser más costoso en términos de capital atrapado de lo que parece en la comparativa de tasas.
¿Cuál tiene mejor soporte y documentación para México?
Conekta tiene soporte en español, equipo local y documentación orientada al mercado mexicano. Para PyMEs sin desarrollador dedicado, esto importa.
Stripe tiene documentación técnica excelente en inglés, amplia comunidad de desarrolladores global, pero soporte remoto sin presencia física en México. Si tu equipo técnico es sólido y lee inglés, Stripe no es problema. Si necesitas llamar a alguien un viernes por la tarde, puede frustrarte.
Mercado Pago tiene soporte en español y documentación en español, aunque la experiencia varía según el canal. El volumen de usuarios que atienden hace que el soporte sea menos personalizado.
Escenarios reales: ¿cuál conviene según tu negocio?
Tienda de moda con ticket promedio de $800–$1,500 MXN y clientes que a veces pagan en OXXO
Conekta. Cubre OXXO sin problema, su tasa en ese rango de ticket es competitiva y el soporte local reduce fricciones operativas.
Agencia de software o servicios B2B con clientes en EE.UU. o con tarjetas Visa/MC internacionales
Stripe. Maneja moneda extranjera, tiene buena cobertura de tarjetas internacionales y los clientes corporativos no pagan en OXXO.
Negocio con canal físico + tienda en línea, o con base de clientes en Mercado Libre
Mercado Pago. El QR presencial, la billetera nativa y la red de millones de compradores activos justifican la comisión más alta si ya operas en ese ecosistema. Este modelo es similar al de la omnicanalidad para pequeños negocios, que integra canales de venta.
Tienda en crecimiento que quiere gestionar pagos como operación, no solo cobrar
Plataformas como T1 Pagos están pensadas para este perfil: más allá del cobro puntual, incluyen gestión operativa de pagos, checkout configurable y conexión con herramientas de prevención de fraude vía T1Score. Si la pregunta es "quiero cobrar y también controlar qué pasa después del cobro", vale la pena evaluarla junto con las tres opciones anteriores.
Tienda que busca complementar pagos de contado con opciones de compra a plazo
Si tu audiencia tiene poder adquisitivo limitado o prefieres ofertar financiamiento, opciones como BNPL (Buy Now, Pay Later) y cómo integrarlo en tu tienda en línea en México son tendencias de pago que crecen en el mercado. Permiten que clientes que no califican con tarjeta accedan a compras a meses sin intereses, lo que puede aumentar tu conversión sin asumir el riesgo de crédito.
¿Qué tan fácil es integrarlas técnicamente?
| Criterio | Conekta | Stripe | Mercado Pago |
|---|---|---|---|
| API REST | ✅ | ✅ | ✅ |
| Plugins para Shopify / WooCommerce | ✅ | ✅ | ✅ |
| Tiempo de integración típico | 1–3 días | 1–3 días | 1–3 días |
| Sandbox / ambiente de pruebas | ✅ | ✅ | ✅ |
| Documentación en español | ✅ | Parcial | ✅ |
Las tres ofrecen APIs bien documentadas. La diferencia real está en el nivel de soporte técnico cuando algo sale mal, no en la integración inicial. Si necesitas conocer más sobre qué es una pasarela de pago, aquí encontrarás cómo funciona una pasarela de pago en detalle.
¿Qué pasa con la prevención de fraude?
En México, los ecommerce representaron el 29% de los pagos con tarjeta entre enero y septiembre de 2025 según CONDUSEF, lo que los convierte en el principal canal de riesgo. Las tres plataformas incluyen herramientas básicas antifraude:
- Stripe tiene Stripe Radar, considerado uno de los motores de fraude más sofisticados técnicamente, alimentado por millones de transacciones globales.
- Mercado Pago aplica reglas de su propio ecosistema de compra-venta, con años de datos de comportamiento mexicano.
- Conekta tiene herramientas básicas de validación; para reglas más avanzadas, necesitarías integrar una capa adicional.
Si el fraude es un problema frecuente en tu vertical (electrónicos, boletos, software), el motor de riesgo pesa tanto como la tasa.
Resumen para decidir hoy
No hay una respuesta universal. Aquí está el filtro práctico:
- ¿Tus clientes pagan en OXXO o efectivo? Si sí → Conekta o Mercado Pago. Stripe queda descartada.
- ¿Vendes a clientes internacionales o recibes tarjetas extranjeras? Si sí → Stripe primero.
- ¿Tu negocio es también físico o tienes base de clientes en Mercado Libre? Si sí → Mercado Pago.
- ¿Tu ticket promedio es menor a $1,500 MXN y operas solo en México? Conekta suele ganar en costo efectivo.
- ¿Necesitas el dinero en menos de 3 días? Conekta (2 días hábiles) tiene la mejor combinación de velocidad y tasa en ese escenario.
Muchos negocios terminan usando dos plataformas en paralelo: una para el checkout principal (Conekta o Stripe) y Mercado Pago como alternativa para quienes prefieren pagar con billetera o en tienda de conveniencia. No es una solución perfecta, pero refleja la realidad del mercado mexicano donde no todos los compradores tienen los mismos hábitos de pago.
Preguntas frecuentes
¿Conekta vs Stripe vs Mercado Pago: cuál cobra menos comisión en México?
Depende del monto de la transacción. Para ventas alrededor de $1,500 MXN, Conekta tiene la comisión más baja considerando el IVA. Para tickets altos (más de $3,000–$5,000 MXN), Stripe puede resultar más económica porque su tasa porcentual es competitiva en montos grandes. Mercado Pago es la opción más cara en tarjeta, pero justifica la diferencia si tus clientes pagan en OXXO o con billetera digital.
¿Mercado Pago cobra IVA sobre sus comisiones?
Sí. Mercado Pago y Conekta desglosan el IVA del 16% sobre la comisión de transacción. Stripe no incluye ese desglose público de la misma forma; verifica con tu contador el tratamiento fiscal correcto para tu régimen.
¿Cuánto tiempo tarda cada plataforma en depositar el dinero en mi cuenta?
Conekta deposita en 2 días hábiles. Stripe tarda 7 días. Mercado Pago ofrece opciones: inmediato (tasa más cara), 14 días o 30 días (tasa más baja). Si el flujo de caja es prioritario, Conekta tiene la ventaja más clara.
¿Stripe funciona bien para ecommerce en México si mis clientes son mexicanos?
Stripe funciona técnicamente bien en México, pero tiene limitaciones importantes: no acepta pagos en OXXO ni efectivo, el soporte es remoto y principalmente en inglés, y los tiempos de liquidación son los más lentos (7 días). Si tus clientes son mexicanos con tarjeta y no necesitan pagar en efectivo, Stripe es viable. Si una parte relevante de tus clientes no tiene tarjeta activa, necesitas complementarla con otra opción.
¿Puedo usar más de una pasarela de pago al mismo tiempo en mi tienda?
Sí. Es una práctica común en ecommerce mexicano. Muchas tiendas usan Stripe o Conekta como pasarela principal para tarjetas y agregan Mercado Pago como alternativa para clientes que prefieren billetera digital o pago en efectivo. La integración técnica depende de tu plataforma de tienda, pero la mayoría de los sistemas como Shopify o WooCommerce lo soportan.
¿Qué pasarela de pago conviene para una tienda nueva en México?
Para una tienda en etapa inicial con clientes principalmente mexicanos, Conekta es un buen punto de partida: regulada en México, soporte en español, acepta OXXO y SPEI, y tiene tasas competitivas en tickets medianos. Si ya tienes volumen o necesitas características específicas (internacional, QR, ecosistema Mercado Libre), evalúa las otras opciones o una combinación.
